目前，我國環境形勢依然嚴峻，老的環境問題尚未得到解決，新的環境問題又不斷出現。在環保部部長周生賢看來，我國“環境質量與人民群眾期待還有不小差距。”同時，基層環保部門存在“小馬拉大車”的現象。
周生賢在環保部官網上公開發表文章提出，迫切需要對生態環境保護管理體制進行改革。周生賢對改革生態環境保護管理體制設計了一整套完整的制度措施。
周生賢認為，應建立統一監管所有污染物排放的環境保護管理制度，獨立進行環境監管和行政執法。
基層環保部門 “小馬拉大車”
周生賢對現行環境管理體制存在的問題進行了深刻剖析，他認為，從現行環境監管體制看，政出多門、權責脫節、監管力量分散等問題明顯存在，影響行政效能，削弱監管合力。
他以2013年以來頻繁出現的嚴重霧霾污染為例說：“2013年以來，我國部分地區霧霾天氣等污染問題集中爆發，人民群眾反映強烈。”周生賢認為，在現行環境監管體制下，執法主體和監測力量分散，缺乏對地方政府和相關部門進行環境執法監督的職能配置，環境監管難以到位，這導致解決突出環境問題的政策措施被打了折扣。
“環境保護是各級政府的重要職責，是必須提供的一項基本公共服務。”周生賢表示，目前，國家層面生態環境保護部門職能分散交叉較為突出，存在權力下放不夠和監管不到位等問題，難以形成嚴格監管的強大合力；基層環保部門被賦予的職能和擔負的任務不匹配，存在“小馬拉大車”的現象。
環境監管統一性和有效性亟待增強
“環境質量與人民群眾期待還有不小差距。”周生賢說，這迫切要求改革生態環境保護管理體制。他認為，改革生態環境保護管理體制是解決損害群眾健康等突出環境問題的有力舉措，環境保護不欠新賬、多還舊賬，需要進一步加強監管。
周生賢呼吁，建立統一監管所有污染物排放的環境保護管理制度，獨立進行環境監管和行政執法。“優先解決損害人民群眾健康的大氣、水、土壤等突出環境污染問題，是環境保護工作的重中之重。”周生賢呼吁，要建立統一監管所有污染物排放的環境保護管理制度，對工業點源、農業面源、交通移動源等全部污染源排放的所有污染物，對大氣、土壤、地表水、地下水和海洋等所有納污介質，加強統一監管。把環境質量反降級作為剛性約束條件。
就實行獨立而統一的環境監管，周生賢認為，應健全“統一監管、分工負責”和“國家監察、地方監管、單位負責”的監管體系，有序整合不同領域、不同部門、不同層次的監管力量，有效進行環境監管和行政執法。
此外，還要加強對有關部門和地方政府執行國家環境法律法規和政策的監督，糾正其執行不到位的行為，特別是糾正地方政府對環境保護的不當干預行為。加強環境監察隊伍建設，強化環境監督執法，推進聯合執法、區域執法、交叉執法等執法機制創新，嚴厲打擊企業違法排污行為。在污染防治、生態保護、核與輻射安全以及環境影響評價、環境執法、環境監測預警等領域和方面，制定科學規范的制度，為實行統一監管和提升執法效能提供保障。
在大氣污染防治方面，京津冀、長三角、珠三角等重點區域已陸續建立聯防聯控協作機制，周生賢認為，其他地方也要結合地理特征、經濟社會發展水平、污染程度、城市空間分布以及污染物輸送規律，加快建立健全區域協作機制。建立區域監測網絡和應急響應體系，聯合應對重污染天氣。
涉及群眾利益的重大決策要聽取公眾意見
周生賢在公開發表的文章中強調了完善環境信息公布制度，健全舉報制度的重要。
周生賢主張，強化環境信息公開，擴大公開范圍，完善公開方式，保障公眾環境知情權、參與權和監督權。“對涉及民生、社會關注度高的環境質量監測、建設項目環評審批、企業污染物排放等信息以及環境狀況、重要政策措施和突發環境事件，要及時公開，主動向社會通報。”周生賢要求，對涉及群眾利益的重大決策和建設項目，要廣泛聽取公眾意見和建議。要引導企業進一步增強社會責任感，真實客觀地公開環境信息，監督企業按規定公開污染物排放自行監測信息。
同時，他要求，健全舉報制度，鼓勵公民、法人和其他社會組織就生態環境問題進行舉報，切實保護舉報人合法權益。
周生賢要求，全面實施環保舉報投訴熱線暢通工程，精心做好環境權益被侵害群眾來信來訪工作，加大受理督辦落實力度。發揮好公眾、新聞媒體和社會組織的監督作用，積極主動回應公眾關心的環境問題。
加強與司法部門銜接推動環境公益訴訟
排污許可是一項國際通用的環境管理制度。據周生賢介紹，我國《大氣污染防治法》、《水污染防治法》等法律對實行排污許可有原則性規定，“但許可條件、程序等具體規定尚未明確。”周生賢提出，要完善污染物排放許可制度，規范污染物排放許可行為，禁止無證排污和超標準、超總量排污。
同時，還要實行企業污染物排放總量控制制度，推進行業性和區域性污染物總量控制，使污染減排與行業優化調整、區域環境質量改善緊密銜接，做到增產不增污或增產減污。
周生賢提出，在總結排污權交易試點經驗的基礎上，加快實施各類排污指標的有償使用和交易，加強排污權交易的組織機構和監管能力建設。
“強化生態環境損害賠償和責任追究，既是保護公民環境權益、維護社會公平正義的重要措施，也是提高企業違法成本、震懾企業違法排污行為的根本對策。”周生賢說，要完善生態環境損害賠償制度，將生態環境損害與公民損害列入賠償范圍。此外，還要建立環境損害鑒定評估機制，合理鑒定、測算生態環境損害范圍和程度。
周生賢要求，加強行政執法與司法部門的銜接，推動環境公益訴訟。對排放污染物造成嚴重后果的，要依法追究刑事責任。
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