水是生命之源，民生之根。近年來，市委、市政府高度重視飲用水安全，全市各地鄉鎮污水處理設施建設項目加快推進。預計到今年底，樂山市將建成投運73個鄉鎮污水處理站。
“六五”世界環境日前夕，市環保局和市中區棉竹鎮主要領導共同商議，將位于棉竹鎮青衣江邊的樂山城集中飲用水源取水口上游1000米半徑，用鐵絲網柵欄圈護起來，以確保城市主要飲用水源地不受到人為污染。接下來還要將原位于樂山大件碼頭大渡河邊的取水口，移至上游的安谷電站庫區。
樂山市中心城區飲用水源主要來自于地表水，地表水的水質決定著飲用水的水質。據樂山市2013年環境質量公報報告：全市8條河流水質總體保持穩定，水質最為優良的是青衣江和大渡河。岷江在進入樂山市境內的斷面監測表明未能達到三類水質標準，但在出境斷面的監測表明達到了規定的水質類別標準。由市環保局環境監測站提供的城市集中式飲用水源地月度檢測報告表明：去年，樂山市兩個市級飲用水水源地和10個縣級飲用水源地水質達標率均為100%。
沐川縣為切實保障馬邊河流域水質安全，從2011年起開展了對舟壩電站庫區網箱養魚的專項整治，在為期3年的環保綜合執法中，縣財政投入資金600余萬元，先后拆除庫區及縣境內的養殖網箱6745口。到去年底，全縣網箱養魚得以徹底消除。該縣還成立了縣境內馬邊河流域綜合執法大隊，加大日常巡查執法力度，堅決杜絕流域及庫區網箱養殖死灰復燃。犍為縣過去對水庫網箱養魚幾經整治，但未能徹底取締，反彈迅速，導致水庫水體污染日益加劇，嚴重影響到水環境質量，威脅到庫區周邊人畜飲用水安全。從2009年起，該縣鐵腕治理水庫網箱養魚，終于在2012年底將全縣的1100多口水庫養魚網箱全部拆除，使庫區周邊老百姓的飲用水質量得以改善。
發源于沙灣區的沫溪河在五通橋區匯入岷江。近年來，沿河兩岸的煤礦企業隨意傾倒矸石，多個場鎮的生活垃圾、生活廢水和建筑垃圾直接排入河中，對沫溪河水體造成了嚴重污染。去年3月，市環保局組織沙灣區和五通橋區的環保力量對沫溪河流域展開交叉執法檢查，責成當地政府采取切實有效措施，加快場鎮污水處理廠建設，對生活垃圾進行集中處理，規范企業的傾倒行為，在加強環保執法中消除了沫溪河水環境的安全隱患，水質有了明顯好轉。
峨邊彝族自治縣五渡鎮在鉀長石開發中，業主在初加工中長期使用酸洗，清洗后的污水直接排入大渡河，污染了河水，侵蝕了水電站的閘門，影響了沿河群眾的飲用水安全。去年底以來，市、縣兩級環保部門開展聯合執法行動，堅決取締酸洗作業，得到企業響應和群眾支持，已有一家企業率先投入2000多萬元上馬濕法磁選工藝，可望在今年6月底建成投用濕法磁選生產線。解決酸洗這個老大難問題后，大渡河的水質將得到進一步提高。
目前，全市的211個鄉鎮中，已有13個鄉鎮的生活污水納入城市污水管網，54個鄉鎮的生活污水處理站已經建成投運，另有19個鄉鎮的生活污水處理站在建設之中。按照市上的規劃，到2020年，全市的鄉鎮污水處理廠將實現全覆蓋。
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